Наборы маркеров генной экспрессии позволят ученым давать адекватную характеристику различным линиям человеческих и мышиных эмбриональных стволовых клеток.

Эмбриональные стволовые клетки обладают огромным потенциалом при разработке новых методов лечения различных заболеваний. Детально охарактеризованные, стабильные, предсказуемо дифференцирующиеся клеточные линии необходимы для получения воспроизводимых результатов, однако на настоящий момент ученые не имеют возможности адекватной оценки различий и сходств между различными линиями стволовых клеток.

Исследователи, работающие в рамках Международной инициативы по изучению стволовых клеток (International Stem Cell Initiative), с помощью методики, разработанной корпорацией Applied Biosystems, провели первое сравнительное изучение обширной и разнородной коллекции линий эмбриональных стволовых клеток, поддерживающихся 17 лабораториями США, Европы, Израиля, Японии и Австралии. При проведении работы авторы использовали несколько методов для идентификации набора генетических маркеров, включающего 93 гена 59 различных клеточных линий.

Несмотря на отличающиеся генетические конституции и методы культивирования, все протестированные клетки имеют общие молекулярные маркеры. Авторы считают, что набор этих маркеров можно использовать для подтверждения плюрипотентности клеток.

С помощью предлагаемых корпорацией Applied Biosystems системы 7900HT для скоростной полимеразной цепной реакции в реальном времени (Fast Real-Time PCR System) и наборов TaqMan авторы идентифицировали во всех проанализированных клеточных линиях 6 ключевых генетических маркеров и 14 дополнительных генов, отличающихся высокой степенью корреляции с ключевыми маркерами плюрипотентности.

На основе полученных результатов компания Applied Biosystems разработала панель TaqMan для определения маркеров плюрипотентности человеческих стволовых клеток (TaqMan Array Human Stem Cell Pluripotency Panel), позволяющую ученым сравнивать экспрессию 96 генов клетками различного происхождения. Кроме того, разработана также TaqMan для маркеров плюрипотентности мышиных стволовых клеток (TaqMan Array Human Mouse Cell Pluripotency Panel), состоящая из мышиных аналогов маркеров, входящих в состав человеческой панели.

Ученые планируют продолжить работу в выбранном направлении путем тестирования дополнительных клеточных линий для подтверждения первоначальных результатов. Кроме того, они собираются проанализировать влияние различных культуральных сред на рост, дифференцировку и генетические изменения клеток. Со сравнительным регистром протестированных клеточных линий и их молекулярных характеристик можно ознакомиться на сайте International Stem Cell Forum (ISCF).

 

Источник: «Коммерческая биотехнология» по материалам Applied Biosystems.